蒙藥的發展在三千年前就有記載，一些傳統蒙藥驗方廣為流傳在民間，人們利用這些眾多民間古方治愈了各類疾病，初步奠定了蒙藥發展的基礎。

    蒙醫學是蒙古族豐富的文化遺產之一，自古以來蒙古族人過著逐水草而游的生活，他們常年與寒冷、潮濕、風雪等自然災害和疾病的斗爭中，不斷的積累實踐經驗，在此基礎上又吸收了古波斯醫學和印度醫學的部分理論，形成了具有蒙醫特色的一門科學。蒙醫藥突出特點是以陰陽五元學的哲學思想為指導觀和六基癥的辯證施治。六基理論則把引起疾病的主要原因是歸納為赫依、希拉、巴達干、血、黃水蟲等六種，把發病部位歸納不臟腑、黑脈、白脈、五官等，千百年來，蒙醫藥學對蒙古民族的繁衍昌盛和防治疾病作出了貢獻，并豐富了祖國醫學寶庫。

    蒙藥的品種繁多，據有關文獻統計，目前蒙醫藥的品種已多達2200余種，常用的1342種，其中屬于植物種子，果實類54種，花類93種根及莖根331種，全草356種，莖葉類84種，其他動物類290類，礦石124種，這些傳統蒙藥被沿用至今，療效確切而可靠，久而卻不老，有不少種藥材是蒙藥專用品種，在常用藥占140種，有些蒙藥與中醫雖然來源于不同植物，但是取用部位不盡相同。傳統蒙藥是長期臨床應用實踐的基礎上逐漸發展起來的，并補充廣大群眾認可，具有很好的療效而無副作用的藥物。